Projet: L’étude du transcriptome à l’échelle de la cellule unique

Présentation

Depuis le début de l’année 2015, nos recherches sur l’épithélium des voies aériennes se sont dotées d’une nouvelle approche permettant une étude à l’échelle de la cellule unique, dans le cadre d’un projet soutenu par la Cancéropôle PACA, l’association Vaincre la Mucoviscidose, l’infrastructure nationale France Génomique et le Conseil Départemental des Alpes Maritimes. Les travaux menés sur plusieurs technologies de séquençage en « single cell » (C1 Fluidigm et Chromium 10X Genomics) ont permis d’acquérir des informations sur plusieurs milliers de cellules dont les propriétés sont désormais étudiées en détail par notre équipe.

Grâce aux données ainsi générées, nous étudions non seulement le développement tissulaire normal, tel qu’il se déroule au cours du développement, mais aussi dans des conditions reproduisant des conditions pathologiques, dans lesquelles des modifications des profils de différenciation sont causées par des niveaux importants de certaines cytokines. Nous travaillons actuellement à modéliser de la façon la plus parcimonieuse les réseaux de régulation génique mis en jeu.