Plateforme UCAGenomiX

Présentation

La plate-forme UCAGenomiX fournit depuis 1999 une expertise en transcriptomique, bioinformatique et génomique fonctionnelle, allant de la conception expérimentale des expériences jusqu’aux analyses bioinformatiques primaires et secondaires et leur interprétation biologique. UCAGenomiX développe en permanence de nouvelles expertises, soit en interne, soit à travers des collaborations scientifiques. Avec un cœur de métier en transcriptomique, elle fournit des données à des résolutions allant jusqu’au niveau de la cellule unique. UCAGenomiX est associée depuis sa création à de grands projets, comme la création de la ressource franco-britannique de puces à ADN Resogen issue d’une collaboration entre le Réseau National des Génopôles et le MRC, le projet « Human Cell Atlas », mené grâce au soutien de la Fondation Chan Zuckerberg, ou le projet 1011 génomes de levures, mené dans le cadre de l’infrastructure nationale biotechnologie-santé France-Génomique, dont la plate-forme est membre fondateur depuis sa création en 2011. Les ingénieurs d’UCAGenomiX éclairent vos études biologiques en incorporant une image détaillée de l’ensemble des évènements génomiques qui leur sont associés

Expertises & services

Séquençage à haut débit sur séquenceur Illumina NextSeq 2000 et Promethion (RNA-seq, DNA-seq, …)
Profilages d’expression génomique sur cellule unique sur technologie 10xGenomics Chromium et Parse bioscience (scRNA-seq, scVDJ-seq, scATACseq…)
Spatiale transcriptomique Merscope (Vizgen) et Xenium (10x Genomics)
Premières analyses bio-informatiques des expériences conduites sur la plateforme.