CRISPR SCREEN UniCA

Présentation

Cette plateforme a pour but d’offrir un soutien sur la technologie CRISPR/Cas9 afin :
–  d’effectuer des expériences de criblage génomique fonctionnel (ciblé ou « genome wide »)
–  d’améliorer la stratégie de vectorisation
–  de réaliser un Knock-out ou un knock-down pour un gène donné dans un modèle cellulaire
– de réaliser des cribles d’expression sur un grand nombre d’échantillons

Applications 

– Conception de cribles phénotypiques ou de cribles transcriptomiques « single-cell »
– Choix du système CRISPR approprié
– Conception et réalisation du modèle cellulaire exprimant la Cas9
– Conception de la banque de sgRNA (criblage ciblé) ou sélection d’une library « genome wide »
– Amplification de la library et production virale
– Optimisation de la vectorisation
– Préparation des banques de sgRNA, séquençage des sgRNA, analyse bio-informatique
– Conseil et/ou conception d’un KO / KD pour un gène donné dans un modèle cellulaire
– Réalisation d’un crible d’expression sur un grand nombre d’échantillons (high-throughput qPCR system)