Sophia Antipolis, le 16 octobre 2017
 

Le « Human Cell Atlas » est un effort international visant à créer un atlas de référence de toutes les cellules du corps humain. Il doit permettre d’établir une ressource accessible à tous pour des études en biologie/médecine. A partir de l’enthousiasme d’un petit groupe de chercheurs, un grand consortium international s’est structuré pour accroître l'impact de la recherche biologique sur les cellules uniques. Les partenaires du projet s'engagent à construire une ressource librement disponible et facilement accessible pour accéder aux données, et à développer les logiciels et standards requis pour l'analyse et le partage des données, en s’appuyant sur les meilleures pratiques de développement open-source et collaboratif.

Cet Atlas doit révolutionner notre mode de perception de l'anatomie humaine et de la biologie cellulaire. Grâce à lui, nous pourrons aborder de nouvelles questions fondamentales sur la progression des maladies et l'état de la cellule. Il permettra le développement de nouveaux diagnostics, de nouvelles cibles médicamenteuses, et intégrera de nouvelles approches informatiques pour mieux stratifier les maladies.

Le « Human Cell Atlas » est un projet international mené à grande échelle et sur le long terme, associant plusieurs des meilleures institutions mondiales de recherche. Les 38 projets pilotes qui ont été sélectionnés pourront jouer un rôle clé dans la mise en place d’outils et de technologies nécessaires à la construction d’un Atlas des 1013 cellules humaines. 481 candidatures ont été soumises au premier appel d’offres, venant d'institutions réparties sur les 6 continents. Les 38 projets pilotes, qui touchent à des travaux de recherche et de développement, émanent de 8 pays situés en Europe, en Afrique, en Asie et en Amérique du Nord. Cette répartition illustre bien la nature mondiale et collaborative de l'Atlas.

Les subventions accordées sur recommandation de l'Initiative Chan Zuckerberg (CZI) seront délivrées par un fonds de la « Silicon Valley Community Foundation ». CZI espère à travers cette initiative soutenir et accélérer le développement de technologies expérimentales très robustes, permettre le déploiement d'une infrastructure d'analyse et de partage ouvert et favoriser la collaboration internationale dans ce domaine. Les deux chefs de file du projet sont le Dr Aviv Regev (Broad Institute of MIT, Harvard, USA), et le Dr Sarah Teichmann (Wellcome Trust Sanger Institute, UK).

Le projet du laboratoire (IPMC, Sophia Antipolis et CHU de Nice – Fondation Lenval) est destiné à établir la carte d’identité des cellules présentes dans les voies respiratoires. Les cellules qui se trouvent dans le nez, la trachée et les bronches remplissent des fonctions essentielles pour permettre le bon fonctionnement de la respiration. Tout dysfonctionnement qui les affecte peut être la cause d’une maladie grave comme l’asthme, la bronchopathie chronique obstructive (BPCO) ou la mucoviscidose. Le projet de L’IPMC est mené en lien avec les équipes de pneumologie adulte et pédiatrique du CHU de Nice – Fondation Lenval (Dr Leroy, Dr Giovannini-Chami, Pr Marquette).